Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg2O55111 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg2O55111 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms