Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms