Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Sdc4O35988 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sdc4O35988 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sdc4O35988 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sdc4O35988 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdc4O35988 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdc4O35988 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdc4O35988 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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