Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaluO35887 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaluO35887 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaluO35887 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaluO35887 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaluO35887 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaluO35887 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaluO35887 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaluO35887 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaluO35887 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaluO35887 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaluO35887 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaluO35887 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaluO35887 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaluO35887 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaluO35887 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CaluO35887 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CaluO35887 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaluO35887 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaluO35887 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms