Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tnfrsf18O35714 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tnfrsf18O35714 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tnfrsf18O35714 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tnfrsf18O35714 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tnfrsf18O35714 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tnfrsf18O35714 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tnfrsf18O35714 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tnfrsf18O35714 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tnfrsf18O35714 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Tnfrsf18O35714 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Tnfrsf18O35714 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tnfrsf18O35714 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms