Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Slc1a6O35544 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc1a6O35544 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc1a6O35544 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc1a6O35544 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc1a6O35544 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc1a6O35544 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc1a6O35544 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc1a6O35544 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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