Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms