Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms