Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc1O35379 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms