Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms