Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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Scarb2O35114 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Scarb2O35114 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Scarb2O35114 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Scarb2O35114 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Scarb2O35114 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Scarb2O35114 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Scarb2O35114 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scarb2O35114 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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Scarb2O35114 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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Scarb2O35114 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Scarb2O35114 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Scarb2O35114 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Scarb2O35114 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Scarb2O35114 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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