Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ArxO35085 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ArxO35085 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ArxO35085 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms