Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AlyrefO08583 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms