Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MsmbO08540 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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