Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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