Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms