Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm2035J3QP87 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm2035J3QP87 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm2035J3QP87 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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