Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6408J3QNG1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6408J3QNG1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6408J3QNG1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6408J3QNG1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6408J3QNG1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6408J3QNG1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6408J3QNG1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6408J3QNG1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms