Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms