Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm11236J3QMS7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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