Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms