Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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