Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms