Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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