Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms