Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12bG3X9I7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms