Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms