Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Usp9yF8VPU6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Usp9yF8VPU6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Usp9yF8VPU6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Usp9yF8VPU6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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