Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdh9F8VPK8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms