Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms