Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Gm28038F7BCN9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm28038F7BCN9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm28038F7BCN9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm28038F7BCN9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm28038F7BCN9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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