Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raph1F2Z3U3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms