Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod3E9QA62 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms