Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp17lbE9Q9U0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp17lbE9Q9U0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp17lbE9Q9U0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp17lbE9Q9U0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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