Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf169E9Q7F2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms