Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms