Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp558E9Q1J0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Zfp558E9Q1J0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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