Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms