Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms