Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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