Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sfta2E9PXB6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms