Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsf1E9PWW9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms