Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms