Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms