Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt2E9PUL5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms