Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1110002E22RikE0CYV9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms