Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms