Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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