Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms