Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rfx8D3YU81 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rfx8D3YU81 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rfx8D3YU81 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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